En silence et avec un mélodrame plus intimiste, "La fleur de mon secret" de 1995, est un film plus modeste dans certains de ses aspects formels mais où la symbiose entre ses protagonistes et Pedro atteint de très hauts sommets. L´histoire d´une femme, laissant les exercices typiques choraux de Almodóvar, déchirée par son désamour, écrite dans un texte magnifique fut suivi avec beaucoup d´intérêt par toute la critique internationale.

"En chair et en os" (1997)est cette fois-ci une histoire plus proche du thriller avec à nouveau de nombreux personnages qui se cherchent à travers le temps.

1999 est une année fondamentale dans la trajectoire de Pedro et le parfait épilogue pour cette chronologie. "Tout sur ma mère"(1999) aura été un succès sans précédant dans le cinéma espagnol, non seulement en salle mais aussi au niveau des dizaines de prix nationaux et internationaux que le film a reçu dont le tant convoité Oscar de Hollywood. Le film fit le tour du monde recevant le même succès partout où il fut projeté.